La razón por la cual las semillas tratadas son mejores es porque la mayoría de las veces, las semillas se tratan con un fungicida que protege la planta cuando es más vulnerable, durante su fase de retoño.
Las esporas de hongos están presentes en el suelo antes de que las semillas sean plantadas. Si un agricultor opta por utilizar semillas no tratadas, descubrirá que un número mucho mayor de semillas ni siquiera llegarán a la fase de retoños antes de que sean invadidas por hongos.
Al usar semillas tratadas, están dando la posibilidad de que la mayoría de las semillas que siembran alcancen la madurez y aumenten el rendimiento total del cultivo.
Hay otras razones para tratar la semilla, algunas funcionan también como insecticidas, pero el tratamiento de la semilla se usa con mayor frecuencia para prevenir infestaciones de hongos en un cultivo juvenil.