Es un emulador de Windows, no un antivirus, por lo que la respuesta es NO.
Puede estar expuesto a virus de Windows ejecutando una aplicación de esta manera y, por esta razón, prefiero ejecutar Windows en VM a través de VirtualBox.
En una máquina virtual, todo se limita a un entorno seguro y su sistema operativo físico no se ve afectado por el malware u otros problemas, en caso de que las cosas vayan al sur.