Sí. Un buen ejemplo que conozco son los arándanos. Historia de los arándanos – Consejo estadounidense Highbush Blueberry. La gente (los nativos americanos) ciertamente los comieron durante mucho tiempo, pero fueron domesticados a principios del siglo XX.
Muchos cultivos especializados son domesticaciones recientes. Los ornamentales son un excelente ejemplo. Conozco a un criador ornamental que está trabajando en el desarrollo de una planta de plátano enano adaptada a las condiciones templadas: produce frutos pequeños pero tiene semillas grandes, por lo que trata de que no tengan semillas.
Los fitomejoradores traen germoplasma silvestre de vez en cuando, aunque la contribución genética de estos individuos es mínima. Por lo general, será un caso de traer un solo gen para la resistencia a enfermedades. También es el último lugar para buscar estos rasgos.
Hay algunos ejemplos más ambiciosos como los granos perennes. Eso es casi un evento de domesticación. Desarrollo perenne de cultivos de granos | The Land Institute
En general, podemos, pero no es una solución muy económica o efectiva para cultivos alimentarios. Ya tenemos muchos buenos cultivos, y sería mejor que intentes introducir un cultivo ya establecido en un nuevo mercado (por ejemplo, kiwi, quinua, vegetales asiáticos).
Realmente no necesitas conocimiento moderno, por cierto para hacer esto. Ciertamente ayuda, pero mucho de esto es una selección visual intuitiva.