La acuaponia combina el uso de la hidroponía con la acuicultura: el cultivo de peces. Casi todos los tipos de plantas crecen bien en acuaponia. La acuaponia es la gran alternativa a los métodos de cultivo actuales. El grupo de plantas que no parece crecer bien es el tipo de vegetales de raíz. Las verduras y hierbas de hoja verde son las plantas más productivas para crecer en el sistema de acuaponia.
Las variedades de ensaladas como los tomates, los pepinos, el pimiento, los chalotes, la lechuga, los chiles, las cebollas rojas y los guisantes de nieve suelen tener el mayor éxito.
Las verduras como los frijoles, el brócoli, la coliflor, el repollo y la berenjena que se usan para mezclar papas fritas también tienen éxito y pueden crecer fácilmente.
Plantar hierbas como albahaca, berro, cilantro, perejil, salvia y limoncillo también son las hierbas que crecen fácilmente en el sistema de acuaponia.
