Cuando estamos cortando una hogaza de pan, ¿estamos cortando sus átomos? ¿Y habrá alguna energía liberada? Y si hay alguno, ¿por qué no es tan poderoso como la fisión nuclear?

No es tan.
Mientras corte un pan, no estoy rompiendo ningún enlace molecular o dividiendo átomos. Un sólido es una disposición de átomos / ítems constituyentes, ya sea de manera o aleatoria. Cuando paso un cuchillo por el pan, lo que estoy haciendo es esquivar ese arreglo ordenado. No abrí un átomo, sino que separé dos átomos que vivían como vecinos. Hay una liberación de energía asociada. Como estoy elevando la energía del sistema (tienes que suministrar algo de energía para desplazar los átomos constituyentes), tengo que trabajar. Esto es hecho por mis músculos a través del cuchillo.
Ahora las transformaciones nucleares son totalmente diferentes. Hay un cambio en el estado de energía a nivel subatómico. Los cambios masivos conducen a la liberación de energía. E = m c2