En algunos huertos, ¿por qué las manzanas se dejan prolijamente apiladas en el suelo?

Diría que las manzanas de hecho no están prolijamente apiladas. Simplemente se ve de esa manera ya que no hay hierba visible en el área debajo de los árboles. Si miras de cerca notas que también hay manzanas en la hierba.

Dicho esto, creo que la razón es que los recolectores han clasificado a esta manzana como de mala calidad y la tiran al suelo en lugar de dejarla en el árbol. Las enfermedades son mucho más fáciles de controlar si la fruta se deja caer y se usa como mantillo. Aunque lo mira desde el punto de vista de la enfermedad, no es ideal dejar tanta fruta, incluso si la fruta está cubierta con mantillo.

La razón también puede ser que la variedad de esa manzana en particular no se desea y se descarta en lugar de gastar recursos en transporte, clasificación y almacenamiento.

También es posible extraer la máquina de las manzanas del suelo, utilizando para propósitos industriales o de procesamiento, como se puede ver en el siguiente video:

Estas pueden ser manzanas de sidra que normalmente se dejan caer o se sacan de los árboles antes de recolectarse del suelo, generalmente mecánicamente. Las manzanas de sidra se magullan menos. Los árboles no han sido entrenados para ser recogidos a mano (altura y anchura), lo que también indica una recolección deliberada del suelo.
Y si las manzanas se descartaban (tal vez una “gota de junio” muy alta, o manzanas enfermas), se las había dejado pudrir y las manzanas en la hierba se habían destruido durante el corte de la hierba.

En todo caso, dejar las manzanas aumenta el riesgo de enfermedad.

Honestamente, no sé la respuesta real, pero supongo que tienen una máquina que recoge todas las manzanas del suelo, y es demasiado grande para acercarse a los árboles sin dañarlos.