Voy a arriesgarme a suponer que podrías haber querido decir “¿comes?”
La diferencia entre “¿estás comiendo?” Y “¿comes?” Es que “¿estás comiendo? Indica que la comida está sucediendo ahora mismo, en el presente simple (presente continuo). Podrías agregar” ahora “a la oración, y tendría sentido si le pregunta a alguien qué está haciendo en este momento.
“¿Tu comes?” está presente también, pero no continuo. Es un tiempo presente simple, y podrías agregar “siempre” (“¿alguna vez comerás?”) Y aún tendría sentido como una ocurrencia presente. “[En este momento] ¿alguna vez comes?”
