No estoy seguro de si usted está preguntando si 1) alguien ordena la comida que está vendiendo como comida para llevar y luego se sienta a comerla o 2) alguien trae comida para llevar de otro restaurante y la come en su establecimiento.
Si la Opción 1: realmente depende de la configuración. Si realmente no hay diferencia entre llevarlo en un plato o en una caja, no veo por qué tendrías que hacer algo. Ocúpate de la inconveniencia menor de tirar la basura y alégrate de haber hecho una venta. Si se trata de un restaurante completo donde tomarán negocios de un servidor, creo que se lo explica educadamente y se les pide que se sienten en el bar, se vayan, etc.
Si opción 2: de nuevo depende de la circunstancia. Si entran solos, probablemente sería justo pedirles que se vayan. Si están con un grupo, alégrate de que estés obteniendo el resto del negocio. Aparentemente, la condición para venir allí era que una persona quería algo más y lo consiguieron. ¡Puede ver lo que obtuvieron y preguntarse si debería ponerlo en su menú!