Los precios varían según la región. Los factores se basan principalmente en los costos laborales, los costos de los alimentos y los costos inmobiliarios. La economía local y las opciones de restaurantes competidores también juegan un papel importante. El patrón regional de precios sugiere que Chipotle pone énfasis en el impacto de los costos de mano de obra y los costos inmobiliarios al fijar precios a Burritos. El noreste tiene los precios más altos con partes del sur y ciudades más pequeñas a precios más bajos.
El diferencial de precios entre Steak y Carnitas con relación a Chicken and Veggie es de entre 48 ¢ y 39 ¢. Los precios de los burritos se agrupan en bistec y Carnitas, que tienen el mismo precio, y el pollo y la verdura, que cuestan lo mismo. El costo de los alimentos para cada grupo está cerca pero no es exactamente el mismo de una región a otra. Sin embargo, Chipotle reconoce que la uniformidad de precios en las regiones es muy importante.
