La única característica química común es que las manzanas rojas tienen antocianinas en sus pieles, mientras que las manzanas verdes no.
Más allá de eso, dos manzanas rojas no están necesariamente más relacionadas entre sí que lo que son con las manzanas verdes. Los genes antocianinas se transfieren fácilmente entre variedades de manzanas cuando se cruzan, por lo que cualquier manzana roja podría tener algunas manzanas verdes en el fondo, y viceversa.
Las primeras manzanas, Malus sieversii, tienen cultivares verdes y rojos, y las manzanas domésticas (M. domesticus) descienden de ellos.
El sabor y otras propiedades de cocción de las manzanas dependen de otros genes. Hay manzanas rojas y verdes (así como moradas, amarillas e incluso negras) en cada categoría: manzanas cocinadas, manzanas que comen, manzanas de jugo, manzanas de sidra. La cría de un cultivar de manzana es un trabajo lento, ya que lleva años que un árbol crezca y produzca frutos, pero los cultivares transfieren genes fácilmente y producen una variedad asombrosa.
Las manzanas comerciales se cultivan específicamente para evitar la producción de nuevas variedades, pero cuando Johnny Appleseed estaba plantando huertos, surgieron innumerables variedades nuevas. La mayoría de las variedades comerciales de hoy en día se encuentran entre los árboles salvajes, o entre los agricultores que siguieron a Appleseed, y algunos de ellos vendieron sus productos a empresas de arboristas por un poco de dinero: eran secretos muy apreciados.
Al final, no se puede decir mucho sobre una manzana por su color, y más de lo que se puede decir sobre una persona por su piel. Las manzanas comerciales vienen solo en algunas variedades (lamentablemente), y usted puede aprender sus propiedades y ponerlas a su gusto.