La capsaicina es un mecanismo de defensa para los pimientos. Disuade a los organismos que destruirían las semillas al comerlas, pero no daña a los animales que pueden ingerir las semillas enteras. Por ejemplo, la capsaicina repele los hongos y algunos insectos, pero no disuade a las aves. Como las aves no mastican, las semillas de pimiento pueden atravesar el sistema digestivo relativamente sin daños, y los excrementos del ave diseminarán las semillas.
Si el pimiento no tenía la capsaicina y en su lugar tenía una composición con un sabor más suave, podría ser más propenso a los organismos destructivos.