Esto parece malinterpretar la razón por la cual los musulmanes no comen carne de cerdo. No es principalmente por razones de salud que los musulmanes no comen carne de cerdo (aunque puede haber algunas razones de salud), es porque es un mandato divino. Surah 2 verso 173 dice:
Él solo te ha prohibido animales muertos, sangre, carne de cerdo, y lo que ha sido dedicado a otro que no sea Allah. Pero quienquiera que sea forzado [por necesidad], sin desearlo ni transgredir [su límite], no hay pecado sobre él. De hecho, Allah es indulgente y misericordioso.
Entonces la prohibición es porque Alá instruye claramente a los musulmanes a hacerlo; de la misma manera, a los musulmanes se les ordena orar en momentos determinados de una manera particular.
Incluso si hubiera cerdos súper higiénicos, esto no cambiaría la naturaleza de la prohibición.