El último ancestro común fue un Eukaryote.
El origen de la célula eucariótica se considera un hito en la evolución de la vida, ya que los eucariotas incluyen todas las células complejas y casi todos los organismos multicelulares. El tiempo de esta serie de eventos es difícil de determinar; Knoll (2006) sugiere que se desarrollaron hace aproximadamente 1.6-2.100 millones de años. Algunos acritarcos son conocidos hace al menos 1,65 mil millones de años, y la posible alga Grypania se remonta a hace 2,100 millones de años. [69] El hongo fósil similar a Geosiphon, Diskagma, se ha encontrado en paleosuelos de hace 2.200 millones de años [70]
Se han encontrado estructuras vivas organizadas en las lutitas negras de la Formación Palaeoproterozoica Francevillian B en Gabón, fechadas en 2.100 millones de años. La vida eucariota podría haber evolucionado en ese momento. [71] Los fósiles que están claramente relacionados con los grupos modernos comienzan a aparecer hace unos 1200 millones de años, en forma de alga roja, aunque trabajos recientes sugieren la existencia de algas filamentosas fosilizadas en la cuenca de Vindhya que datan de hace 1.6 a 1.7 mil millones de años. [72]
Los biomarcadores sugieren que al menos los eucariotas del tallo surgieron incluso antes. La presencia de esteras en las lutitas australianas indica que los eucariotas estuvieron presentes en estas rocas con una edad de 2.700 millones de años. [73] [74]