Esta es una explicación muy simplificada:
La verdadera harina de trigo fresca y triturada en casa es simplemente bayas de trigo que se han molido (y de preferencia se usa inmediatamente porque empieza a ponerse rancio).
La harina de trigo que puede comprar en la tienda ha sido filtrada.
La harina blanca ha tenido la más saludable (y las partes que se echan a perder más rápidamente) y también se blanquea (aunque se puede comprar harina blanca sin blanquear).