Probablemente incluso sería seguro si también te comieras la mosca, siempre y cuando tu sistema inmune sea normal.
Las bacterias siempre presentes generalmente solo lo enfermarán si hay suficientes para superar su sistema inmunológico.
La cantidad de microbios en una mosca no tendría tiempo suficiente para multiplicar esos números en solo una hora.
Largos tiempos en el microondas pueden no ser necesarios tampoco. Si la comida en cuestión contenía una cantidad decente de agua, necesitarías 5 minutos como máximo para destruir la mayoría de las bacterias.
Y una hora tampoco sería suficiente para que las bacterias produzcan suficiente toxina para enfermarse (si fueran de ese tipo).